大數據雲計算 基因測序平民化

大數據雲計算基因測序平民化

[2015.11.08] 發表

【明報專訊】深圳眾多創新高科技企業中，有一間全球最大的基因組學研發機構「華大基因」。華大16年前成立於北京，8年前南下，獲得深圳政府大力支持，已成為中國基因研究的「少林寺」。上個月，華大宣布與英特爾、阿里巴巴合作，利用雲計算、大數據將其核心服務「基因測序」大幅減價，讓人人都可測基因。有專家相信，現有的醫療模式將被改變。

明報記者楊立贇深圳報道

攜帶人類遺傳信息的脫氧核糖核酸(DNA)由兩萬多個基因組成，由4種核苷酸以不同順序排列。現時，透過血液或唾液可測定基因的完整序列，並可「解讀」及預測罹患癌症等疾病的可能，相關產品和技術已有臨牀應用。

華大基因的前身是中科院遺傳研究所人類基因組中心，1999年加入美國發起的國際人類基因組計劃(HGP)，華大基因研究中心在北京註冊成立。2007年，華大創始人、現任董事長汪建預見到，隨着高通量測序儀(同時可對幾十萬至幾百萬條DNA分子測定序列)面世，基因測序市場即將「爆發」，但當時中科院不同意大批購入設備，最終分道揚鑣，汪建等人南下深圳，成立深圳華大基因研究院。

學術分歧華大創始人南下

當時深圳政府希望在科技領域領先其他城市，華大為擺脫體制束縛、避免學術爭議，兩者一拍即合。華大落戶深圳鹽田僅4個月，即發布「第一個中國人基因組圖譜」，其後提出「百人基因組計劃」，將基因組圖譜擴展到100個黃種人、100個黑種人及100個白種人。

目前，基因測序向大眾普及的最大障礙是價格高昂，一次人體全基因組測序全套服務價格約10萬元人民幣。上月華大與英特爾、阿里巴巴旗下的阿里雲合作，透過英特爾計算平台，打造基因測序和計算一體機，分析用戶數據；同時利用阿里雲的數據處理和存儲，提高計算效率，從而降低成本。

華大基因執行總裁尹燁對本報稱，相比25年前，一次基因測序的成本已從30億美元降至目前1000美元，未來或許只需要幾百元人民幣，「甚至幾厘錢，這就是普惠精準醫療」。剛辭任華大CEO另立門戶的王俊亦公開宣稱，「應該讓人人都能免費測基因」，相信一個新興產業將要來臨。但一名華大員工透露，這只是一種商業模式，表面低價甚至免費測基因，實則在解讀基因報告和後續醫療中收費。

向華大招手深圳3年撥款6000萬

深圳政府公開信息稱，2007年，深圳市和鹽田區政府不遺餘力地支持華大。《時代周報》引述深圳原副市長唐傑稱，在引入華大基因時，深圳承諾3年內每年撥款2000萬元人民幣；2010年，深圳政府促成國家開發銀行向華大貸款15億美元。華大利用部分資金從美國供應商宜曼達(Illumina)購買128台Hiseq2000型號測序儀，一躍成為全球最大基因測序機構。

去年8月，深圳市長許勤在一次會議上表示，「要以對未來發展高度負責的態度和責任擔當」，借助政府「有形之手」與市場「無形之手」，全力支持華大基因科研成果推廣應用和產業化，「為我國搶佔生物技術和產業制高點」。他說，生物技術是繼信息技術之後，發展潛力和空間最大、對經濟社會影響最深刻的高技術領域。