針對有新型冠狀病毒肺炎患者的糞便檢測出核酸陽性，國家衛健委高級別專家組組長鍾南山院士昨(2日)回應稱，新型冠狀病毒有可能通過糞口傳播，應高度警惕。中國疾控中心副主任馮子健則表示，目前糞口傳播(即接觸或進食受感染者糞便污染過的物件而傳播)還沒得到證實。

鍾南山接受《南方日報》採訪時稱，新型冠狀病毒有可能通過糞口傳播，現在應該引起重視和高度警惕。他說，在湖北、江西有些地方，確實有使用便桶習慣，還放在魚塘洗，確實要引起防控注意。患者糞便帶病毒的數量，仍要一步步調查。初步來看，尿目前還沒有，但糞便確實要引起注意。

《新京報》也引述香港大學醫學院微生物系教授張其威稱，目前雖然還沒有檢測到活病毒，僅是核酸檢測呈陽性，顯示有活病毒的概率非常高，因此新型冠狀病毒有可能通過糞便途徑傳播，或者通過含有病毒的糞便形成氣溶膠(微粒懸浮狀態)再傳播。

馮子健表示，目前糞口傳播還沒有得到證實。他指，患者糞便的核酸檢測呈陽性，和分離到病毒有很大區別，「核酸裏面是活病毒還是病毒核酸的片段，這個現在無法判斷」。他表示，首先要確定糞便中的病毒是不是活病毒，其次要看它能不能傳播，再看其傳播的作用和大小。中疾控中心已開展相關工作，但何時有結果尚難預測。

生態環境部周六(1日)已通知地方各級生態環境部門，要求高度重視醫療污水和城鎮污水監管工作，防止新型冠狀病毒通過糞便和污水擴散傳播。