蔡奇進京後也逐漸顯露出強硬一面，消息人士稱，2015年7月大抓捕維權律師、維權人士的「709案」，時任國安委常任副主任蔡奇是決策者之一。這一具有國際影響的打壓人權事件，讓蔡奇官聲頗受影響。此外，《國家安全法》亦是在蔡奇擔任國安委大管家期間推出並施行。 習近平2014年初將北京定位為「全國政治中心、文化中心、國際交往中心、科技創新中心」後，北京開始疏解「低端人口」，這項重任如今落在蔡奇肩上。9月初，蔡奇到東城、西城就推進核心區規劃建設管理調查研究時強調，要以更大力度推動核心區非首都功能疏解，把人口密度、建築密度、旅遊密度、商業密度降下來，使核心區靜下來，歷史文化街區要防止商業過度。整治「拆牆打洞」(封起挖穿圍牆對外經營的街舖)是具體措施之一，卻因斷了不少普通民眾的生計而遭受非議。
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