氣象廳周四晚表示，截至周五上午8時，熊本地區已發生餘震共116次，其中餘震震度最大達6級以上。而地震海嘯監視課長青木元在記者會上表示，「今後1周左右有可能發生烈度在6級左右的餘震」，提醒居民加以注意。

安倍晉三周五早上在首相官邸，出席緊急災害對策總部第2次會議。他表示，已下令各部門全力救災，又向死難者家屬致哀，並稱由於持續出現餘震，當局將全力防止二次災害。他又說，當局視居民安全為最重要的事項，全力搶救生命、救出被困災民及提供救助，同時在食品物資供應和確保醫療方面，全力支援災民。

此外，首相官邸的危機管理中心已成立對策室，收集地震相關資訊。而防�壑j臣中谷元則在防�嶼晱l開的災害對策會議上，聽取有關自�懦分蝐洠a民等活動情況的報告。經濟產業相林幹雄稱，今次地震對物流及物品採購等企業的影響，不如東日本大地震這麼大。

內閣官房長官菅義偉呼籲災區民眾冷靜，以及互相幫助。日本政府根據熊本縣發出的災害派遣請求等情況，已派出自衛隊、警察和消防人員等3000人以上到災區進行救援活動。