台灣高鐵串連南北生活圈，但沿線噪音讓民眾苦不堪言，全台認為高鐵「太吵」向環保署陳情的，包括苗栗、桃園、新竹和雲林。但高鐵員工私下抱怨，桃、竹、雲住戶都是政府劃定高鐵路線後才出現，卻要高鐵承擔責任，「難不成要高鐵搬走？」

高鐵全長345公里，交通部高鐵局表示，沿途經11縣市77鄉鎮市區，環保署目前規定桃園市龍樹坑等17處敏感地區，做背景噪音位準監測，只要列車運行分貝太吵，一定加裝隔音牆隔音窗。

除苗縣通宵鎮城北里外，桃園市蘆竹區六福路居民認為高鐵太吵；台灣高鐵指出，桃園是環保署「陸上運輸系統噪音管制標準」中，交通噪音管制標準第三、四類管制區，噪音需在85分貝以下；但環保署測得六福路87分貝，因此已提加裝隔音牆或替住戶裝隔音窗改善計劃。

至於高鐵新竹站與尚未啟用的雲林站附近居民，也對高鐵運行噪音不滿；經地方環保局偵測，都符合標準，就未進行後續改善計劃，至於當地居民是否申請公害糾紛調處，高鐵公司說「不曉得。」

不過高鐵員工透露，桃園、新竹和雲林都是高鐵畫定路線、興建後才蓋房子，地方政府卻劃成分貝數較低住宅區，使高鐵無論如何改善噪音，都容易影響居民。「高鐵先進駐，後到居民卻抗議，邏輯不太對」，不過高鐵說，已盡力在人口密集處加隔音牆，減少紛爭。

如高鐵竹北六家站旁有2社區大樓，部分住戶曾向高鐵抗議噪音，但經實測，開窗下噪音都在85分貝以下標準值，且大樓都是高鐵通車後才建，當初都行文建商注意噪音，提醒建商設計隔音建築，經溝通後居民多無意見。