換頭手術除了引起醫學界的道德爭議外，同時也會扭曲病人對「身分」(identity)的認知。到底病者在接受換頭手術後，他們仍是原來的那個人，或是成為了身體捐贈者，以其身分繼續生活下去？法律上亦衍生同樣的身分問題。即使是卡納韋羅，也承認這是醫學技術以外需要解決的問題。 卡納韋羅於2013年時曾指出，就算病人的換頭手術成功，也不代表整個程序已圓滿。因病人的形象及身分，不論在個人認知及法律上，仍然有待釐清，病人也需時習慣新的軀體。 英國專門研究身分認同的著名哲學家帕菲特(Derek Parfit)認為，記憶、信仰、欲望等非物質的概念，是一個人對個人身分認同的由來，故此病人在換頭後，因保存了本身的思想及記憶，所以他會相信眼前的「我」，就是其原本的身分。
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