韓國檢察廳跟司法部向來雖然工作緊密無間，但並沒有從屬關係或謂孰高孰低。當檢察機關對法官展開濫用司法權調查，司法部即抗拒檢察破壞法院權威，引發了這兩大陣營的「戰爭」。負責調查的檢察官抱怨法官阻撓，十居其九否決批發搜查令，但檢方表明將極力防範全面衝突。 法官主張法院內部調查 檢察自7月以來，為「濫用司法行政權」調查向法院申請過208次搜查令，獲批得23次，批發率僅11%。然而首爾中央地方檢察廳本年迄今所申請的其他案件搜查令，批准比率卻達99%。例如2014年10月勞動部為全國教職員工會未依法申請成立訴訟，向大法院提出上訴，其間法院行政署有與青瓦台交換意見、介入訴訟嫌疑；檢察上月兩度向法院申請搜查當年法院行政署法官的辦公室和寓所等，可是法院不接納檢方的主張，批指「看不出」法官們可能直接製作或保有文件。
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