出生於1982年的孔令欣是孔子76代後人。在香港讀完中學後，2004年於英國牛津大學物理系獲學士學位，2005年再在英國劍橋大學獲碩士學位，2009年於英國劍橋大學獲理論物理博士學位，2009年至2012年於加拿大Perimeter Institute任博士後，2012至2014年在美國哈佛大學物理系任博士後。 2014年起任復旦大學研究員，同年入選中組部「青年千人」計劃。 孔令欣說，她之所以今日能在物理方面有所建樹，完全得益於當年在香港中學任職物理老師的父母影響。「曾經在讀中學的時候，我的理科也並不是特別出色，還有過一兩次不及格。後來父親給了我一本相關的專業書籍，我看了下去，發現這裏面太有趣了，於是就迷戀上了物理。」 父母任物理老師 送書啟發 孔目前從事的是量子物理學的基礎研究，她自己也笑稱，與實際生活應用關聯不大。 孔的主要研究包括規範場論╱引力場論對應 (AdS/CFT Correspondence)的研究，尤其是它在量子糾纏及量子信息學的應用。 2013年中旬，她與合作者進一步發現場論中的糾纏熵所滿足的不等式跟引力理論中的愛因斯坦方程有重要關聯，這一發現對於最終理解量子引力的結構有重要的啟示。
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