自從位於中美洲的瑪雅人在約公元前1500年開始食用朱古力後，人類便一直食用，現時仍然是一種受歡迎的食品，且有更好的理由而享用、尤其是黑朱古力(Dark Chocolate)，黑朱古力最少含50%從可可豆磨出來的可可粉或由它提取的可可脂，與牛奶朱古力不同，黑朱古力並不是從牛奶製成的，雖然可能在製做的過程中受交叉污染而含微量牛奶，質量較低的黑朱古力可能含油脂、牛乳脂和人工香料。
黑朱古力含黃烷醇(Flavanols)、些許纖維及多種礦物質，包括鎂(Magnesium)、鋅(Zinc)、鐵(Iron)、磷(Phosphorus)和銅(Copper)等。用來製做朱古力的可可豆富含黃烷醇，可可豆特有的黃烷-3-醇(flavan-3-ols)是純可可食品苦澀味道的來源。黃烷醇具抗氧化和抗炎的特性，所以有以下對健康的好處——
(1)保護心臟：多份研究結果顯示黑朱古力具抗氧化、防止血栓形成和降血壓功能，且可改善血管的彈性和功用，從而預防動脈硬化，有保護心臟和血管的功效，減少患上冠心病和中風的風險。
(2)減低患上糖尿病的風險：黃烷醇會增加細胞對胰島素的敏感度，從而降低患上糖尿病的風險。
(3)平衡免疫系統：黃烷醇防止免疫系統超速運作及氧化壓力(oxidative stress，當自由基與抗氧化物比值間不平衡的狀態，尤其是自由基過剩的情況下，抗氧化物被過度耗損的失衡狀態，這是導致多種疾病的病因)。
(4)改善腦功能：包括反應時間、視覺空間意識和記憶力等。
(5)增強運動表現。
(6)舒緩壓力。
不過，進食朱古力也可為健康帶來不良的影響：
(1)黑朱古力含不少糖份、脂肪和熱量，所以，應只適量享用。美國心臟協會建議每天攝取少於25至36毫克添加糖(取決於個人的性別和體重)，所以，每天進食一、二盎司足以達到對健康的好處，由於不同朱古力棒的大小和重量有別，所以，應查看標籤每一份所含的重量、及其他成份(例如添加糖和脂肪等)。
(2)有些朱古力棒含鉛和鎘等重金属，就算是有機的朱古力棒也可能含這些重金屬，這會對健康帶來不良的影響，包括腸胃不適、發育遲緩等。
(3)在某些人，朱古力會誘發胃酸倒流或偏頭痛。
(4)朱古力含咖啡因，所含的可可成粉愈高、咖啡因的含量也愈高，一份兩盎司的朱古力大約含50-60毫克咖啡因，相比一杯八盎司的咖啡所含100-222毫克咖啡，所以，對咖啡因有特別反應，例如心跳、睡眠失調等的人要小心。
朱古力含的可可成份愈高，所含對健康有益的黃烷醇也愈多，大部份的研究結果都顯示進食最少含70%可可成份的黑朱古力才能達到對健康的好處，暫時仍未有明確的指引，進食多少才能達到這些好處，但多數專家的意見是偶爾享用最少含70%可可成份及經最少加工程序的黑朱古力。
選擇和購買：
(1)選擇最少含含70%可可成份的黑朱古力，值得留意的是所含可可成份愈高、苦澀味就愈濃。
(2)儲藏在清涼乾爽的地方，放在密封的容器裏，不要冷藏，以免出現「白霜」(chocolate blooming)現象，這不是黴菌，而是糖份在遇上過度潮濕時於朱古力表面凝結的自然現象，這不會影響朱古力的味道，也不需拋棄。可將朱古力熔化、攪拌均勻、然後讓它慢慢冷卻形成固體後便可食用。
(3)適當儲藏的黑朱古力可保留至兩年。
