【明報專訊】香港法例第499章《環境影響評估條例》訂明，所有大型工程必需做環境影響評估研究，以評估工程對環境可能造成的影響，並提出紓緩措施。環評報告經過法定公眾諮詢、由環境諮詢委員會提供意見，環保署長決定批發許可證才可施工。
2012年5月，機管局向環保署提交三跑工程簡介，展開環境影響評估程序；2014年4月，機管局公布環評報告。2016年4月，三跑方案獲行政長官會同行政會議通過，並於2016年8月正式動工，預計新跑道最快2022年啟用。不過，三跑工程可能造成的海洋污染、空氣污染和噪音污染一直為人詬病。
●海洋污染
環保團體認為工程區並沒有屏障阻止海洋生物進入，船隻造成的水質污染破壞海豚棲息地，令中華白海豚消失於香港水域
●空氣污染
公民黨根據前港大公共衛生學院社會醫學系講座教授賀達理設計的達理指數，推算三跑啓用首10年，會有約308人直接因空氣污染惡化而死亡
●噪音污染
運輸及房屋局在2014年的立法會上公布文件指，鄰近機場的馬灣經常錄得高噪音，居民擔心因三跑而增加的飛機升降會加劇噪音
就公眾和環境諮詢委員會的關注和意見，機管局在環評報告內承諾推行250項緩解和改善措施，例如：
1. 以免挖方法填海，例如採用深層水泥拌合法
2. 航油管道改道工程採用定向鑽挖法，深入海牀以下的石層
3. 機場南跑道於夜間處於備用狀態
4. 禁止飛機在廊前停機位使用輔助動力裝置，並增加電動車數目
5. 設立新海岸公園，為中華白海豚提供更佳保護，免受施工、快船和漁業資源被過度捕撈的威脅
6. 在三跑施工及營運階段，來往珠海和澳門的快船改道，並在中華白海豚數量多的範圍限制船速
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