台灣經濟部指阿里巴巴涉嫌隱瞞陸資身分進入台灣，罰款阿里12萬元新台幣(近3萬港元)。國民黨立委蔡正元在facebook表示，「經營團隊是馬雲和蔡崇信，經濟部只因馬雲創業成功，名氣太大，就偏狹認定『阿里巴巴是陸資公司』，這種腦袋實在太落伍！」

指經濟部因馬雲名氣生偏見

台經濟部指，凡陸資佔30％以上、或陸資對一家公司有「實質控制力」，都算是陸資公司。蔡正元對此反駁指，馬雲是大陸人、蔡崇信是台灣人，阿里巴巴的大陸人持股遠遠小於30%，根本不能算是陸資公司，而且蔡崇信也有董事提名權，也有實質控制力，「要不要算台資公司？」《華爾街日報》則報道，台灣的決定不至嚴重影響阿里巴巴業務，因阿里的核心業務仍在大陸，台灣僅有14萬用戶，但阿里整體註冊用戶2012年已達3600萬。